Sowohl in der Vollversion als auch in der Demo von Mini Ninjas sind zwar die Helden putzig-klein, der Bösewicht aber in Sachen Bosheit richtig… böse! Ein grantiger Samurai-Kriegsherr hat nämlich nichts besseres zu tun, als aus harmlosem Viechzeug willenlose Schergen zu machen, mit denen er die Herrschaft über das Land anstrebt. Doch zu seinem Unglück stellt sich ihm ein ansässiger Ninja-Klan in den Weg, der mit den Plänen des Kriegsherren so gar nicht einverstanden ist.
Mit sechs Ninjas mit jeweils unterschiedlichen, individuellen Fähigkeiten rennt, hüpft, schleicht und kämpft man sich durch die bunte Fantasywelt von Mini Ninjas und stellt sich allerhand Gefahren und gigantischen Bossgegnern. Dank des recht niedrigen Schwierigkeitsgrads ein Spiel für die ganze Familie.