Die sechste Welt in Super Mario Bros. Wonder sind die Magma-Tiefen. Sie ist recht umfangreich und der Schwierigkeitsgrad ist ebenfalls fordernd. Die Magma-Tiefen umfassen sechs Level, eine Luftgaleere, einen Palast sowie zahlreiche Abzeichen-Tests und ein paar andere Herausforderungen.